Паркування в аеропорту Чеське Будейовіце наразі безкоштовне. Є два паркінги загальною місткістю 900 автомобілів, що цілком покриє основний трафік протягом літнього сезону.
Головна автостоянка
Велику автостоянку можна знайти відразу після повороту з головної дороги.
Вона розташована з лівого боку в напрямку терміналу і пропонує місце для 700 автомобілів.
До терміналу можна дійти пішки або скористатися маршрутним автобусом, який курсує щонайменше раз на 15 хвилин у зв'язку з вильотами та прильотами. Автобус безкоштовний.
Невелика автостоянка біля терміналу
За декілька хвилин ходьби від вестибюлю аеропорту є ще одна невелика автостоянка. Однак вона розрахована лише на 180 автомобілів і буде повністю заповнена у високий сезон.